遺傳學家一直認為蘇格蘭折耳出現是一個錯誤，“軟骨骨質化發育異常” 是折耳貓的遺傳性骨骼病，其四肢，尾部和關節畸形和折耳顯性基因如影隨形。表現為僵直尾巴，腳部嚴重畸形，無法支撐身體重量，及內彎生長的指甲，長到可能會穿透腳掌。
這種畸形從貓的2月齡開始逐漸表現，未入成年貓咪的痛楚就非常明顯。目前獸醫只能用藥物舒緩病情，幫助貓咪減輕痛楚及減慢惡化速度。
貓咪要在痛楚及藥物伴隨下度過一生。一些病情嚴重的貓咪，骨骼病變的情況會慢慢蔓延至脊骨，令貓咪癱瘓并引致極大的痛楚。當貓咪無法承受那種痛楚時，安樂死可能是主人最大安慰的選擇。
就對于這種遺傳病，目前沒有辦法可以根治，而且病情大多會不斷惡化。基于這種情況，遺傳學家呼吁放棄這種貓的繁殖是對貓咪最大的愛護。